导致黄体功用不全的一个重要原因，是卵泡发育不良。因为黄体发育是卵泡发育的持续，因而任何影响卵泡成长和发育的要素都将影响黄体功用。
高催乳素血症
研讨指出，适量的催乳素对保持正常黄体功用是必要的。过高的催乳素可直接效果于卵巢的β-羟固醇脱氢酶而影响孕酮的组成，导致黄体期缩短、闭经、溢乳和不孕。据报道，黄体功用不全患者中，约40%伴有高催乳素血症。
子宫内膜异位症
子宫内膜异位症患者，黄体功用不全者占25%-45%。子宫内膜异位症与黄体功用不全的联系，现在尚不清楚。
跟着生殖内排泄的开展，实时超声和内窥镜的归纳使用，使不孕症的病因了解得愈加详细和详细。一份黄体功用不全的研讨报告指出：47例黄体功用不全患者，腹腔镜和激素测定证实为LUFS者16例，占34%。
医院性要素
氯米芬可致黄体功用不全。在一组氯米芬促排卵病例中发现50mg剂量组虽有排卵，但20%的病例有黄体功用不全。其机制或许是氯米芬直接影响子宫内膜对激素的反响。醋甲孕酮具有溶黄体效果，其他一些药物，如乙烯雌酚、恢复龙、止吐灵等也可引起黄体功用不全。
流产
据统计，83%流产患者可恢复排卵，但其血孕酮值低于正常，一旦再次妊娠，流产率高。这或许与血孕酮值水平低，子宫内膜发育不良影响孕卵着床有关。